Bilinen tarihi Midiliçoğlu Çiftliği adıyla başlar. Devlet tarafından işletilen bu çiftlik daha sonra 1950 yılında Bulgaristan'ın çeşitli bölgelerinden gelen göçmen vatandaşlarımıza iskan edilmiştir. Eski adıyla Midiliç olarak bilinen bu köye 1958 tarihinde Aydıngün Köyü adı verilmiştir.
Köy doğal güzelliklerinden ötürü Yerköy ilçesinin en cazip mesire yeridir. Ayrıca köyün doğal çim sahasının güzelliği nedeniyle il ve ilçenin futbol takımlarının antreman yeridir. Köyün ünlü yemekleri kuru fasülye, mercimek, biber turşusu, pancar pekmezi, kabak tatlısı ayrıca hamur işleri yoğun bir şekilde yapılır. Kendine has fırınlarında yaptıkları günlük taze somun ekmeği ve peyniri çok meşhurdur.Ve ayrıca arabaşı meshurdur.Ayrıca bu köyde sünnet düğünleri ve cemiyetlerde geleneksel yağlı güreş ve at yarışları yapılmaktadır. aydıngun koyu halkının okuma yazma oranı yuzde yuzdur koyun evlerınde suyu mevcuttur kanalızasyon vardır koy tam bır emeklı cennetıdır emeklı oranı cok yuksektır geleneklerı ve goreneklere sahıp cıkılmıs ve yasatılmıstır bolgede ornek koy ılan edılmıstır.
Yozgat iline 52 km, Yerköy ilçesine 12 km uzaklıktadır. Köyün hemen altından Kızılırmağın kolu olan Delice'ye bağlı Killiközü Çayı geçmekte ve çevresini yeşillendirmektedir. Ayrıca bu çay 2-3 çeşit balık türü barındırmaktadır...
Seçildiği Yıllara Göre Köyümüzün Muhtarları:
2009 - Faik Hoşgeldi
2004 - Kemal Biçer
1999 - Kemal Biçer
1994 - Naim İşbilir
1989 - Naim İşbilir
1984 - İbrahim Küçük
1979 - Ömer Küçüköz
1977 - Tevfik Yerköylü
1974 - Haşim Girgin
1973 - Tevfik Yerköylü
1969 - Hasan Küçük
1964 - Hasan Küçük
1959 - Hasan Yıldırım
1950-1959 - Yusuf Bilir